Uusi Bioinformatiikka Varten Linux

Seal on Python-moduuli, joka tarjoaa sekvenssirinnastuksen päällä Hadoop.Seal on MapReduce hakemus biologisen sekvenssirinnastuksen. Se toimii Hadoop (http://hadoop.apache.org) kautta Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), Python MapReduce ja HDFS API...

avalanchetoolbox on työkalupakki tunnistaa ja kuvailla aluevaltaus prosesseja, kuten neuronien lumivyöryt. Vaatimukset : ...

Murka on vapaa, cross-platform ja avoimen lähdekoodin komentorivin ohjelmisto, jonka avulla käyttäjät voivat helposti ratkaista Phylogeny ongelman yksinkertaisesti käyttämällä Mediaani Networks. Se sisältää heuristisia menetelmiä, tarkka algoritmeja, sekä...

HTSeq on Python puitteet käsitellä ja analysoida tietoja korkean suoritustehon sekvensointi (HTS) määritykset. Vaatimukset : < li>...

Orange-bioinformatiikka on Orange tiedonlouhinta ohjelmistopaketti lisäosalla. & Nbsp; Se ulottuu Orange tarjoamalla yhteisiä toimintoja perustehtävistä bioinformatiikan. Se tarjoaa myös widgettejä Orange Canvas, joiden avulla käyttäjät, jotka eivät ole...

edittag on sovellus kokoelma suunnitteluun sarjaa muokkaa metristä sekvenssimerkkejä, tarkkailun järjestyksessä tageja ulkomuotoa muokata metristä, ja integroimalla sekvenssimerkkejä laiturille erityisiä sekvensointi adapterit ja PCR-alukkeet. edittag...

VULCAN hanke tarjoaa virtauslaskenta analyysi.VULCAN (Tahmea vastatuuliasteikko algoritmi Complex virtausanalyysiin) tarjoaa virtauslaskenta ääntä hitaampien nopeuksien kautta hypersonic myrskyisä reagoimaan ja ei-reagoimaan rahavirrat eri sarja- ja...

seriesoftubes on laajennettu kaasuputken Solexa ChIP-seq tietoja.Pakkaus Documentation Vaatimukset : ...

reciprocal_smallest_distance on pairwise orthology algoritmi, joka käyttää maailmanlaajuisesti sekvenssirinnastuksen ja suurimman uskottavuuden evolutiivisen etäisyys sekvenssit tarkasti havaitsee ortologeille välillä genomien. Asentaminen tarpaketin...

Build-järjestelmissä, kuten make käytetään usein luomaan monimutkaisia ​​työnkulkuja, esim bioinformatiikan. & nbsp; snakemake pyritään vähentämään monimutkaisuutta luoda työnkulkuja tarjoamalla puhdas ja moderni verkkotunnuksen erittely, kieli (DSL)...