Uusi Bioinformatiikka Varten Linux
Geant4 hanke on työkalupakki simulointi kulkua hiukkasten kautta asiasta.Sen sovellusalueita ovat korkean energian fysiikka ja ydinkokeita, lääketieteen, kaasupolkimen ja avaruusfysiikan tutkimuksia. Mitä uutta tässä julkaisussa: uusi malli gamma...
STEME Hanke alkoi elämä lähentämistä Odotus-maksimointi algoritmi sopivaa mallia käytetään motiivi etsijöitä kuten MEME.STEME & rsquo; s EM lähentämisestä toimii kertaluokkaa nopeammin kuin MEME toteutus tyypillinen asetukset. STEME on nyt kehittynyt...
Genepidgin on kokoelma Python työkaluja, jotka auttavat arviointia ja toimeksianto geenin tuotenimet. & Nbsp; On kolme pääkomponenttia:genepidgin * siivooja *& Nbsp; yhtenäistää geeni nimet per UniProt Nimeämisohjeetgenepidgin * vertailla *& Nbsp; vertaa...
kapsidi kattavan avoimen lähdekoodin alusta, joka yhdistää korkean suorituskyvyn laskennallisia putki taudinaiheuttajan sekvenssin tunnistamista & nbsp; ja luonnehdinta ihmisgenomeissa ja transcriptomes yhdessä skaalautuva tuloksia tietokantaan ja...
Miso (isoformien seos) on todennäköisyyksiin puitteet kirjoitettu Pythonilla että kvantitoi ilmentymistasoon & nbsp; vaihtoehtoisesti liitettyjä geenien RNA-Seq tietoja, ja yksilöi eri tavoin säännelty isomuotoja tai eksoneissa poikki...
MACS2 on mallia, joka perustuu analyysiin työkalu ChIP-Seq tietoja.Parannuttua sekvensointitekniikoilla, kromatiinia immunosaostus seuraa korkea suoritusteho sekvensointi (ChIP-Seq) on tulossa suosittu opiskella genominlaajuisten...
biotools on nippu bioinformatiikan apuohjelmia kirjoitettu Pythonilla. Vaatimukset : ...
PathVisio on avoimen lähdekoodin ja täysin ilmainen graafinen sovellus toteutettu Java-ohjelmointikielellä ja suunniteltu alusta asti käyttää näyttämiseen, analysointiin ja muokkaamiseen biologisia polkuja alle GNU / Linux-käyttöjärjestelmä system.Can...
Pathomx (ent MetaPath) on avoimen lähdekoodin graafinen ohjelmisto toteutetaan IPython, Qt ja PyQt, suunniteltu alusta asti toimimaan interaktiivinen apuohjelma visualisointi ja analysointi metabolisen tietojen GNU / Linux ja muut POSIX & nbsp;...
