NeuronVisio

Software kuvakaappaus:
NeuronVisio
Ohjelmiston tiedot:
Versio: 0.8.6
Lähetyksen päivämäärä: 20 Feb 15
Kehittäjä: Michele Mattioni
Lupa: Vapaa
Suosio: 96

Rating: 5.0/5 (Total Votes: 1)

NeuronVisio yhdistää NEURON käyttämällä uutta Python NEURON käyttöliittymä.
Asennus:
Voit asentaa NeuronVisio sinun täytyy täyttää seuraavat riippuvuudet
& Nbsp; * pygtk
& Nbsp; * visuaalinen
& Nbsp; * matplotlib
Helppo asennus
Helpoin tapa saada neuronvisio on, jos sinulla on setuptools asennettu:
easy_install neuronvisio
Ilman setuptools, se on vielä melko helppoa. Lataa neuronvisio.tgz tiedosto neuronvisio n Cheeseshop sivu, Pura se ja ajaa:
python setup.py asentaa
Documentation
Dokumentaatio on saatavilla doc kansioon tai verkossa.
Pika
Tämä koodi on vain antaa ajatus, miten käyttää nrnvisio moduuli:
1. tulipalo up ipython konsoli pylab kytkimellä .:
& Nbsp; ipython -pylab # Jos et käytä kytkintä et näe mitään kaavio.
2. Tuo moduuli:
& Nbsp; neuronvisio.controls Tuontivalvontaan
& Nbsp; valvonnan = Controls ()
Kun nrnvisio käynnistetään lanka on käynnistetty. Tässä lanka kaikki prosessin nrnvisio tapahtuu tukkimatta konsoli.
Koska nopea esimerkki seuraava koodi:
& Nbsp; 1. Luo yhden jakson nimeltään Soma
& Nbsp; 2. Aseta Hodgkey-Huxleyn kanava ja passiivinen johtokyky
& Nbsp; 3. Aseta alphaSynapse tarjota Stimul.
Nopea esimerkki voi olla seuraavat ::
alkaen nrnvisio.controls tuonnin valvonta
valvonta = Controls () # käynnistäminen GUI
alkaen neuroni tuonti h # Getting HocInterpreter
Soma = h.Section () # luominen osio
soma.insert ("hh") # asettaminen HH kanava
soma.insert (pas) # työntämällä passiivinen johtokyky
syn = h.AlphaSynapse (0,5, sek = Soma) # synaptic tulo
syn.onset = 0.5 # kun tuleen
syn.gmax = 0,05 # konduktanssi synapsien
syn.e = 0 # kääntyminen potentiaalia
Lisää esimerkiksi esimerkissä hakemiston osoittavat, miten käyttää Neuronvisio monimutkaisempia malli.

Ominaisuudet :

  • 3D visualisointi malli mahdollisuus muuttaa sitä runtime
  • luominen vektorien nauhoittaa muuttujien läsnä osiossa
  • Pylab integraatio piirtää suoraan simuloinnin tuloksena
  • Exploration timecourse minkään muuttujan kesken kertaa käyttäen värikoodatut asteikko
  • GUI toimii omassa säiettä joten on mahdollista käyttää konsolin (erittäin suositeltavaa ipython)

Vaatimukset :

  • Python

Vastaavia ohjelmistoja

Gabedit
Gabedit

11 May 15

basemap
basemap

14 Apr 15

OpenVRML
OpenVRML

14 Apr 15

Gwyddion
Gwyddion

26 Apr 16

Kommentit NeuronVisio

Kommentteja ei löytynyt
Lisää kommentti
Ota kuvia!