Arabidopsis Motif Scanner (AMS) on Windows-sovellus, joka toimii paikallisen tietokoneissa. Se kehitettiin rakentaa geeni verkostoja tunnistamalla kannat cis-säätelyelementtejä mallissa tehtaan Arabidopsis thaliana ja tarjoamalla helpon käyttöliittymän ja arvioida geenin suhteita. Sen merkittävä innovatiivinen piirre on yhdistää cis-sääntelyyn elementti kantoja, NGS ja DNA Chip Arrays ekspressiotietojen, Arabidopsis merkinnät ja geenien vuorovaikutuksia tunnistamiseksi geenin verkkojen säätelee transkriptiotekijät. Pyrittäessä keskitetysti transkriptiotekijät toiminto, ohjelmisto käyttää ilmaisua tietojen ja sitomiskohta motiiveja säätelevä geeni alueiden ennustaa suoraan kohdegeenien. Lisäksi AMS käytetään DNA-proteiini ja proteinprotein vuorovaikutus tietojen tunnistamisen helpottamiseksi Metaboliateiden säätelee transkriptiotekijä kiinnostava.
Kommentteja ei löytynyt