Bioinformatiikka Benchmark-järjestelmä on yritys rakentaa kohtuullisen testaus puitteet, testejä ja tiedot, jotta loppukäyttäjät ja toimittajat koetin hoitavat järjestelmiä.
Mitä me yritämme tehdä on luoda puitteet testausta, ja ydinjoukko testit, jotka kaikki voivat ladata ja käyttää koetin tiettyjä elementtejä järjestelmien suorituskykyä.
Lisäksi lähde nämä testit ovat saatavilla GPL ja isännöivät Bioinformatics.org ja skaalautuva Informatics LLC Ajatuksena on mahdollistaa loppukäyttäjille, kuluttajille, järjestelmät kehittäjien, ja muut helposti rakentaa ja käyttää kuvaavia testejä mittaus- ja tuning syistä .
Joe Landman alkaen Scalable Informatics LLC suunniteltu idea ja kirjoitti alkuperäisen koodeja. Etsimme uusia benchmark koodia ehdotuksia, testejä, aineistoja jne
Nykyinen perustasotestit useita NCBI BLAST kulkee useita HMMER kulkee, ja erilaisia muita. Aiomme sisällyttää ClustalW, X! Tandem, erilaiset kemiaa, dynamiikkaa, ja niihin liittyvät kokeet, sekä useita muita.
Testit kuten Linpack tai HPL yksinkertaisesti eivät tarjoa mielekästä tulosindikaattoreita tai ennustemallit korkean suorituskyvyn tietojenkäsittelyn. Valitettavasti eivätkä Viimeaikaisissa ja keskittynyt testejä.
Tämä on ongelma, koska Linpack ja HPL erikseen testata suorituskykyä eri matriisilaskutoimituksia, jossa sinulla on käytännössä säännöllinen muistin käyttöön malleja, ja erityisiä matemaattisia laskutoimituksia.
Nämä koodit ovat eniten hyötyä verrattuna koodeja raskaita liukulukulaskennassa, ja limitetty muistin liikennettä. Nämä koodit ole suunniteltu kattavia järjestelmiä benchmarking, jossa levy I / O, muisti latenssi, ja muut tekijät vaikuttavat kaikki suorituskykyyn liittyviä ongelmia.
Paras testit ovat ne, jotka ovat eniten muistuttavista koodit ajaa koneeseen. Testejä itsessään olisi kohtuullinen arvio todellisen suorittamisen koodin avulla todellisia tietoja. Saatat joutua leikata se takaisin saadakseen realistisen ajoajat.
Sinun pitäisi olla kohtuullinen alaerä kokoja. Yksi ainoa testi ei kerro, miten järjestelmä skaalautuu, ja yksi syy existance testi on nimenomaan avulla voit testata suorituskykyä ja voit lisätä eri osa työmäärän.
Sinä harvoin lepotilassa järjestelmä klusterin, joten suosittelemme, että yrität ajaa realistisena toimintaympäristön kuin mahdollista. Lähtötasosta lepotilassa järjestelmä on hieno, mutta se voi asettaa odotuksia kohtuuttoman.
top
Kommentteja ei löytynyt