CWC Simulator

CWC Simulator on C ++ täytäntöönpanoa CWC, hammaskivi edustus ja simulointi biologisten järjestelmien. & Nbsp; Onnistuneen asennuksen jälkeen (katso ASENNUS) voit ajaa simulaatioita yli CWC mallia, kuten on esitetty joitakin esimerkkejä (katso esimerkit /).
(Command-line) Interface
Koska yleinen käyttäjä, sinun pitäisi ajaa:

-i model.cwc
-o
-t
-s
-n
-c
--qt kynnyksen
-q
-w
Missä:
- on nimi suoritettavan (oletus: scwc);
& Nbsp; - model.cwc on panos CWC-ohjelman (katso esimerkit);
& Nbsp; - tilastoissa on lähtö-tiedostot etuliite;
& Nbsp; - on simulaatio-määräajassa;
& Nbsp; - on näytteenoton ajankohta (eli 0,12 saada 250 pistettä määräaikaa = 30);
& Nbsp; - on määrä tapauksia simulointi;
& Nbsp; - on määrä klustereita kun k-means
& Nbsp; - on kynnys QT klusterointi
& Nbsp; - on määrä kvantiilit;
& Nbsp; - on tavallisesti vastaamaan useita sydämiä järjestelmästä (eli 4 quad-core CPU).
Output
Työkalu tuottaa:
- Jotkut Dat-tiedostot (otokseen tuotos simulaatiot)
- Jotkut gnuplot skriptejä tehdä tilastollisia analysises
Olemme töissä kattava käyttöohje.

Ominaisuudet

• Gillespie SSA algoritmi yli CWC mallia
• Hybrid stokastista / deterministinen semantiikka
• Useita tapauksia simuloinnin online-tilastot
• Optimization moniydin- arkkitehtuureille perustuu FastFlow puitteista
• Extensible tilastolliset puitteet (keskiarvo-varianssi, suodatettua klustereiden jne.)
• Multiple luokitus semantiikka (massa toiminta, Michaelis-Menten, Hill jne.)