Gephi

Gephi on keino tuoda, tutkia, muokata, analysoida, suodatin, clusterize, spatialise ja vienti suurten kuvaajat ja verkostoja.

Mikä on uusi tässä julkaisussa:

• Tämä julkaisu keskittyy uusia ominaisuuksia sekä käyttäjien ja kehittäjien, ja uusi lisenssi avaa mahdollisuuksia liiketoiminnan. Ranking ja Preview-moduulit on kirjoitettu kokonaan uudelleen modulaarisesti ja voi nyt laajentaa plug-ins! Preview voidaan nyt laajennettu monin tavoin, esimerkiksi ryhmä muotoja tai reunasta niputtamista. Lisäksi jatkuva edistyminen on tehty dynaaminen verkko tukee ja julkaisemme tänään viimeinen iso osa: tilastot ajan, saatavilla Tilastokeskuksen moduulin, kun verkko on dynaaminen. Kiitos käyttäjille, jotka raportoitu vikoja, se on ainoa tapa korjata niitä.

Mikä on uusi versiossa 0.7 Beta:

• Uusia ominaisuuksia:
• Uusi Data Laboratory (Manipulate sarakkeet, Etsi / Korvaa, Merge, Sparklinet ...)
• Pituussuuntainen verkon visualisointi, topologia muuttuu ajan myötä, samoin kuin attribuutteja
• Aikajana toimii nyt oikein, näyttöön tulee automaattisesti, kun kuvaaja on dynaaminen, yhden painikkeen avulla suodatuksen
• Näytä / Piilota tarroja suodattimet - voidaan nollata "Reset Visible 'toiminta (vasen kuvaajan ikkunan)
• Näytä reuna painoa etikettejä visualisointi
• Uusi Stax GEXF tuoja ja viejä, jolla on hierarkia ja dynaamista tukea
• Uusi Lista / Arrays ominaisuus tyyppejä. Voi vain tuodaan GEXF nyt.
• EI Operator (Suodattimet)
• MASK Operator (Filters) - pitää reunat mukaan source / target / molemmat / tahansa - voi helposti saada naapurit solmujen
• Tasoita Filter - Litistä hierarkkinen kaavion näkyvän mielestä muuntaa meta-reunat osaksi normaalia reunoihin
• Uusi Giant Komponentti suodatin
• Aikataulu maahantuonti, uuden vaihtoehdon "Tuo Report tuoda peräkkäisiä staattisia tiedostoja ja muuntua dynaamista
• Zoomausliukusäädin visualisoinnissa vaihtoehtoja
• 'Tuo puuttuvat solmut "vaihtoehto tuonti mietinnössä - valita, luoda niitä vai ei
• Aseta koko "Reset Size" toimintaa, jonka oikealla klikkaamalla reset koon painike
• Ota tutkinto sarakkeen undirected kaaviot
• Tilastot raportit nyt tallennettu Gephi hankkeisiin
• Uusi "skaalaus Paino-vaihtoehdon Preview, pakottaa paino näyttää samalta kuin Yleistä
• Uusi "Original" vaihtoehto reunojen väri esikatselu, säilyttää alkuperäisen reunan värin, tulevat Partition esimerkiksi
• Kopioi ja siirtyä solmut uuden tai olemassa työtila
• Uusi esikatselu pikavalinnat
• lokalisointi on nyt mahdollista, ja muutos kieli Gephi
• Kun rinnakkain reunat löytyy tuonnin aikana, se nyt lisää painoa reunan oletuksena
• Vaihtoehto Ego Filter sisällyttää isäsolmuun vai ei
• Meta-reunoilla on nyt erillinen asteikon liukusäädintä Visualisointi asetukset, muuttaa paksuja niitä verrataan normaaliin reunoihin
• Ranking ja Partition ominaisuusluetteloon nyt lajitellaan
• Sijoitus nyt päivittää itsensä suodatettua kuvaajat. Klikkaamalla Levitä päivittyy rajat ja muutos (väri, koko) on oikea
• Nyt on mahdollista vetää suodatin sub kysely tullut tärkein kyselyn
• Kun dynaamisia ominaisuuksia, Ranking, Partition, visualisointi ja suodattimet käyttää nykyisen Aikajana-alue löytää arvot
• Edge paino voi olla dynaaminen, tyyppiä DYNAMIC_FLOAT. Force Atlas layout käyttää nykyistä Aikajana-alue
• Suodattimet päivitetään, kun kuvaaja on muutettu, nykyinen suodatin reexecuted
• lokalisointi on nyt mahdollista, ranska ja espanja on pian saatavilla
• Bugikorjauksia:
• Väärä reuna poistetaan Edge Paino suodattimen (bugi 603469)
• suodatus kupera rungon näytetä (bugi 541819)
• NullPointerException suodatettaessa undirected kuvaajat (bugi 571153)
• NullPointerException maahantuontiin dynaamisen kuvaajan (bugi 581872)
• Gtk + liukusäädintä ongelma (bugi 529913)
• Meta-reunat eivät näy (bugi 584283)
• esikatselu ei näy meta-reunat (bugi 584289)
• virheet kanssa Yifan Hu Monitasoinen Asettelu päälle suodatetun kuvaajan (bugi 594643)
• Node Koko tila ja suodatin paramaters eivät tallenna projektin (bugi 596430)
• Muisti Vuoto GEXF / GraphML Parser (bugi 596872)
• Virheellinen keskinäistä reuna painon Preview (bug 610469)
• Edistystä ei ole esitetty, kun avaat / säästö hankkeessa (bugi 594644)
• Ei voida peruuttaa hankkeen aukko (bugi 616415)
• Hitaus on poiminta osion merkinnän (bugi 519549)
• EdgeList Tietokanta Configuration ei tallenneta (bugi 571263)
• 'start "ja" pää "attribuutteja puuttuu, kun vientiä dynaaminen GEXF (bugi 521848)
• Partition & quot; Kaikki Mustat & quot; feature randomizes värit (bugi 601066)
• Suodatusperuste kuvaajan ole viedään & quot; Valitse & quot; painetaan (bug 573685)
• Partition Asetukset Suodatin ei tallenneta työtilojen välillä siirtyminen (bugi 616052)
• avaaminen arkistoituja ZIP-tiedostot on rikki (bugi 578876)
• Poikkeus on klikkaamalla "Hierarkia" juostessa monitasoinen layout (bugi 631663)
• GraphML maahantuoja ei tuo solmu tarroja data (bugi 581629)
• ei voi tallentaa / tallentaa kuin avattaessa Gephi DoubleClick kuvaajan Windows (bugi 583397)
• ForceAtlas ja Fruchterman Reingold eikä layout meta-reunat (bugi 584286)
• muistivuoto kaaviosta Etäisyys (bugi 587450)
• NullPointerException toteutettaessa & quot; ominaisvektori- Centrality & quot; Tilasto (bug 589731)
• NullPointerException vaihdettaessa työtiloja, kun asettelu on käynnissä (bugi 597458)
• Ei vedä suodatin sub-kysely tulla root kyselyn (bugi 626495)
• Ranking parametrit alustetaan uudelleen jokaisen uuden ranking (bugi 594231)
• Ranking ei päivity, kun kuvaaja suodatetaan (bugi 632459)
• Node näkymättömiä (liian pieni), kun luotu solmuun lyijykynällä (bugi 574807)
• Virhe avattaessa Plugin Center (bugi 616829)
• ei voi valita Postgresql ohjaimen tietokantaan tuonnin asetukset (bugi 595223)
• ei voi näyttää reuna painon tekstinä (bug 603134)
• Tuo muunnos undirected eivät sulaudu paino (bugi 603478)
• Klikkaa hiiren oikealla työtilan poistamisen jälkeen solmu heittoja & quot; solmu voi olla tyhjä & quot; (Bug 605947)
• In / Out astetta metrinen ei toimi undirected kuvaajat (bugi 606305)
• NullPointerException valittaessa & quot; - Valitse Layout & quot; Layout ComboBox (bugi 606964)
• Workspace valinta ei virkistää sulkemisen jälkeen työtilan (bugi 616814)
• Visualisointi valinta väri inversio välillä "out" ja "sekä" color (bugi 618726)
• 'Format "ei kirjata DL tuonnissa (bugi 619069)
• Muokkaa-ikkuna ei piilossa välilehtiä (bug 552494)
• dynaamisia kuvaajan tunnistamaton jos ikuisen solmut (bugi 555637)
• FileNotFoundException aikana säästö PDF-tiedoston (bugi 572876)
• & quot; Node on oltava kaavion & quot; virhe tuotaessa hierarkkinen kuvaajan korkeus on yli 1 (bugi 577180)
• Auto-asteikko kääntää kuvaajan (bug 577843)
• Impossible peruuttaa Average Reitin pituus tilasto laskelma (bugi 590226)
• Preview-suhde ei ollut saatavilla ensimmäistä kertaa (bugi 594176)
• Default valikoima Solmut Data Laboratory tarpeen (bugi 594515)
• & quot; CommandLineParsing null & quot; viesti, kun virhe avattaessa tiedosto komentoriviltä tai työpöydällä (bugi 594630)
• ei voi tuoda samaa tiedostoa kahdesti Welcome ikkunassa (bugi 598157)
• csv tiedoston vienti ongelma (bugi 598767)
• ei voi sulkea projekti luotaessa kuvaajan (bugi 631341)
• Visualisointi kokorajoitusta (bugi 602470)
• kahtena etikettiin suodattimen ikkunassa (bugi 604003)
• Väliseinät älä päivitä avattaessa projekti eikä Yleistä (bug 612902)
• z-koordinaatti ei viedä GraphML (bugi 614606)
• Väärä solmun tehtävissä asetettaessa X tai Y nollaan (bugi 615844)
• Valittu suodatin kysely ei oikein pirteänä UI (bugi 626483)
• Vie pdf tausta on aina valkoinen (bugi 583386)
• SVG-tiedostoja ei ole lueteltu Export dialogi (bugi 626394)
• Väärä solmukokoa kun ranking on sama min ja max koko (bugi 631689)
• Lue kantoja piste tiedostoista (bugi 594793)
• Ranking ja Partition parametrien luettelo ei ole tilattu (bugi 594520)
• Node tutkinto ei Label Teksti asetukset (bugi 598170)
• Väärä kansio valitaan Export Panel vaihdettaessa tiedostotyyppi (bugi 620337)
• tuottaa kuvaajan aiemmin ladattu suuntaamaton verkko (bugi 624671)
• Väärä aivohalvaus paino kun SVG tuodaan Illustrator (bugi 626378)
• Suodatus ei päivity, kun sub-kyselyt asettaa tai poistaa (bugi 594511)
• Virheet on PDF-vienti, kun etiketit on fontin kokoa nolla (bugi 626865)
• Text eivät näy Preview (bugi 627567)
• Reunat native väri eivät näy Preview (bugi 586237)
• Edge paino asteikko on erilainen välillä Graph ja Preview (bugi 569329)
• Negatiivinen reunoja ei suoritetuista Preview (bugi 628223)
• reunat paino ei sulautunut samansuuntaista reunaa (bugi 648600)
• Partition suodatin suodattaa automaattisesti nolla (bugi 648600)
• Poikkeus avattaessa projekti tiedosto (bugi 648617)
• Ego Suodatin ei sisällä solmu itse (bugi 649908)
• PDF Vie vain oletuskirjasimen (bugi 651273)
• solmut eivät valitsematta sammuttamisen jälkeen valinta suodatin Panel (bugi 649920)
• API:
• Lisää Litistä () menetelmä HierarchicalGraph litistää hierarkkinen kuvaajan ja muuttaa meta reunat osaksi säännöllistä reunoihin.
• Lisää tuhota (suodatin suodatin) on FilterBuilder saada ilmoituksen, kun suodatin kyselyn poistetaan ja puhdistamiseen.
• Lisää MetaEdgeBuilder kaaviosta SPI mahdollistaa mukautetun rakentajille. Add GraphSettings.setMetaEdgeBuilder () in kuvaaja mallin asetukset.
• Muokkaa StatisticsModel tallentaa raportteja suoraan sen sijaan Statistics oikeusasteessa. Tämän seurauksena, malli on nyt getReport () ja getResult () menetelmä, joka UI voi käyttää. Tällä hetkellä käynnissä tilastot voivat nyt saada uuden getRunning () menetelmällä.
• yksinkertaistaminen ja parantaminen määrite tapahtumien hallintaa. Event kuuntelijat nyt tilata suoraan AttributeModel sijaan AttributeTable ja saavat tapahtumia kaikille taulukoita. Refaktorointi of AttributeEvent luokan AttributeTable lähteenä ja uuden AttributeEventData objektin tiedot. Uuden SET_VALUE on toteutettu saada tapahtumiin kun määreet asetetaan.
• Muutokset AttributeRowFactory, newNodeRow () menetelmä nyt ottaa omistaja objektin NodeData parametri. Vastaavasti newEdgeRow () ja newRowForTable ().
• Lisää getEdge (Node, Node) vuonna GraphAPI johdonmukaisuuden vuoksi.
• Muutokset prosessori SPI. Prosessori on nyt antajien sijaan prosessi () menetelmän parametreilla. Miten prosessorit luodaan pysyy samana. Luominen ProcessorUI liittymä prosessorit asetusvalikkoarkin. ProcessorUI toteutus tarjoaa paneeli, joka näkyy, kun tuonti raportin sulkeutuessa. ProcessorUI mahdollistaa myös poistaa prosessori joitakin ehtoja.
• Lisää getColor () menetelmä NodeDraft ja EdgeDraft.
• Määritä & quot; Yleistä, & quot; Data Laboratory & quot; ja & quot; Preview & quot; näkökulmia. Luo uusi SPI varten perspecives ja näkökulma jäseniä. Jäsenet ovat yksinkertaisesti TopComponent jotka kuuluvat näkökulmasta. Plugins voidaan toteuttaa PerspectiveMember määritellä avautuvat ja sulkeutuvat käyttäytymistä.
• Lisää lista / array nimikkeet Ominaisuudet API. Kaikki syntyperäinen tyypit on nyt liittyvän listan tyyppiä, paitsi dynaamisia tyyppejä. Lista tyypit perii AbstractList.
• Muutoksia tavalla Import API käsittelee aikavälein ja dynaamista tietoa. Tukee dynaamisia ominaisuuksia on lisätty uusi addAttributeValue () menetelmä NodeDraft ja EdgeDraft. Parantaa tietojen cleanup mahdollisuuksia, NodeDraftGetter ja EdgeDraftgetter nyt palauttaa AttributeRow sijaan luettelon määreet vain. Lopulta hyötyä viimeisimmät parannukset, luonnos elementtejä palauttaa suoraan TimeInterval tyypin sijaan luettelon viipaleiksi. Menetelmiä "Slice" on nimetty uudelleen "Interval" johdonmukaisuuden vuoksi.
• Lisää dynaamisia tyypit osaksi määritteet API. Dynaaminen tyypit tallentaa arvot aikaväli ja kysely voidaan räätälöidä estimaattorien. Kaikki dynaamiset tyypit perivät DynamicType
• Kaavio API tapahtumien hallintaan parannuksia. GraphEvent on nyt tarkka tapahtumia, kuten ADD_NODES, REMOVE_NODES, ADD_EDGES, REMOVE_EDGES ja VISIBLE_VIEW. Uuden GraphEventData käyttöliittymä on luotu hakea elementtejä liittyviä tapahtumia.
• Export API refaktorointi, innoittamana ImportAPI. Luo ExporterBuilder liitäntä viejän luomiseen ja eri viejien: GraphExporter, VectorExporter, ByteExporter ja CharacterExporter joka kattaa yhteiset tapaukset. Tapa viejät kirjoittaa dataa on rationalisoitu käyttämällä joko java.io.Writer (teksti) tai java.io.OutputStream (tavu). ExportController on parannettu tukea kaikkia use-tapaukset, kuten tiedostojen, kirjailija ja stream viennin.
• Lisää Spigot tukea ImportAPI ja SPI. Kuten DatabaseImporter, SpigotImporter käyttöliittymä on uudenlainen Maahantuojat. Muutoksia on myös tehty ImportController tukemaan hana tuontia.
• Refaktorointi ja parannuksia Tuo API ja SPI. Refactoring Tavoitteena on ratkaista Singleton ongelma maahantuojien ja antaa käyttäjien toteuttaa rakentajat käyttöliittymä, joka luo maahantuojat tapauksessa. Siksi ImporterBuilder käyttöliittymä on luotu, ja olisi rekisteröitäväServiceProvider merkintä. Eri tuojien tyyppejä on yksinkertaistettu ja jättää enemmän valinnanvaraa toteutukset miten tulo johdetaan. XML ja Tekstitiedosto maahantuojien on sulautettu FileImporter käyttöliittymän, kanssa java.io.Reader. Utility staattisia menetelmiä, esimerkiksi saada dokumentti Reader löytyvät nyt uudessa ImportUtils luokkaa. ImportController on yksinkertaistettu varten Tiedoston tuonti- ja hyväksyy nyt java.io.Reader myös. Tärkein parannus kyseisiä moduuleja tukea UI komponentteja maahantuojille. Tavoitteena on antaa tuojille määritellä ImporterUI täytäntöönpanoa hallita asetuksia tuojista.
• Parannuksia GraphAPI tunnisteiden hallintaan. Järjestelmä on nyt varastointia String tunnisteita lähtöisin käyttäjille. Uusi getters ja laatijoiden menetelmiä on luotu Graph: Graph.setId (Node, String), Graph.setId (Edge, String), Graph.getNode (String), Graph.getEdge (String). NodeData.setId () ja EdgeData.setId () menetelmät on poistettu, yhteensopivuutta ei voida säilyttää. Tehdas on myös muuttaa, jotta luoda elementtejä String ID suoraan, koska se ei ole enää mahdollista tehdä sitä NodeData.
• Muutokset AttributesAPI kanssa tapahtumien hallintaan. Lookup järjestelmä AttributeTable on korvattu enemmän perinteinen tapahtuma hallintajärjestelmä, jossa uudet AttributeEvent ja AttributeListener rajapintoja. Lähettäminen täytäntöönpano on nyt erillinen säiettä.
• Muutokset Tuo moduulit erilliset ytimen ja käyttöliittymiä. ImportController on nyt tekemässä tuonti tehtävän vain ja uusi ImportControllerUI näyttävä käyttöliittymä (Report Panel). ImportControllerUI rajapinta sijaitsee DesktopProject moduulin ja tulisi käyttäjä oikein tuoda tiedoston Plugins. ImportController menetelmiä voidaan käyttää alkaen työkalupakin.

Mikä on uusi versiossa 0.7 Alpha 4:

• alfa4 julkaisu on juuri julkaistu, ja tulevat joukko uusia ominaisuuksia ja monia bufixes. Seuraava julkaisu tulee olemaan beta, ja niissä on enemmän vakautta ja kiinteä joukko ominaisuuksia.

Mikä on uusi versiossa 0.7 Alpha 3:

• Yli 25 bugit on korjattu tässä versiossa , ja pieniä ominaisuuksia lisätty. Versio lisää myös & quot; Gephi 3rd Party & quot; plugin lähde Plugins keskustassa. Verkkokauppa on nykyisin luetaan sekä virallisissa että 3rd party lähteistä. Kaksi uutta moduulia on lisätty.

Mikä on uusi versiossa 0.7 Alpha 2:

• Uusia ominaisuuksia:
• Parempi reuna painon tukea. Paino ei ole muutettu enää by & quot; automaattinen mittakaavan & quot; vaihtoehto Tuo.
• Better solmua / reunojen laskentaa. Laskee näkyvissä vain solmuja.
• Paranna Tilastot / Metrics asetuksia paneelit. Lisää kuvaus ja dokumentaatiota mittareita ja niiden asetukset.
• Projektin tallentaa / ladata on korjattu. Huomaa, että yhteensopivuus 0.7alpha1 on rikki.
• Fix AutoUpdaten mekanismi. Muita päivityksiä ovat saatavilla kautta sisäänrakennetun updater.
• Bugikorjauksia:
• Sovelluksen jäätyä tuotaessa tiedosto Linux (bug 519423)
• Asettelu ikkuna ei voi palauttaa, kun on telakoinnista (bugi 519424)
• Anner eivät näy Mac OS X ja Linux (bugi 522403)
• Esikatselu ei piilota suodatettu elementtejä (bugi 522402)
• Projektin kuormitus / tallenna liitäntä epäonnistuu (bugi 522889)
• tyhjä solmu etiketti aiheuttaa virheellisen virheilmoituksen aikana tuonti & quot; unkown solmun id & quot; (Bug 519254)
• GDF viennin, poistaminen sarake ei poista pilkku (bug 519810)
• GDF vientiin, Id kenttä on pahasti karannut (bugi 519820)
• Taito reuna suodatus kurittomuus (bugi 522771)
• Context tietoja ei toimi suuntaamaton verkko (bugi 522886)
• Dynaaminen suodatin näyttää 0 solmun (bug 523128)
• valinnat tag toimii vain yhden kirjaimen arvot (bugi 519252)
• suosikit, Kiinteistöt ja lähtö-valikko näkyy ikkunassa, ja ei voi sulkea. (Bug 521400)
• parantunut suorituskyky säädettäessä alue hiirellä (bugi 521939)
• kiinteä bug käsitellessään dynaamisia tietotyyppejä muut kyseistä päivämäärää (bugi 521544)
• kiinnitetty bugi visuaalista jakautumista asteikko (bug 521941)
• Käytettävyys:
• Node ja Edge toggle painiketta VizBar on sama työkaluvinkkiteksti
• Raportti Panel (Tuo) on pystysuorassa laajennettavissa
• Päivitetty moduulit:
• DesktopContext
• DesktopBranding
• DesktopHierarchy
• DesktopPartition
• DesktopRanking
• DesktopTools
• VisualizationModule
• DesktopImport
• DesktopLayout
• ProcessorPlugin
• DHNSGraph
• DesktopTimeline
• TimelineAPI
• TimelinePluginUI
• ExportPlugin
• ImportPlugin
• StatisticsPluginUI
• GraphAPI
• ExportPluginUI
• PreviewImpl
• DesktopPreview
• FiltersPlugin
• ImportAPI
• DesktopFilters
• ProjectAPI

Mikä on uusi versiossa 0.7 Alpha:

• Gephi 0,7 alpha-versio on julkaistu ja se on saatavilla testausta varten. Koska 0.7 on täydellinen uudelleenkirjoitus, se tarvitsee alfa ja beta versiot jäädytti ominaisuudet ja korjaa kaikki viat.
• Kaikki jäljellä olevat 0,6 vikoja poistuu nyt.
• Toinen huomautus lähdekoodia: Sinun täytyy päivittää NetBeans 6.8 nykyisen moduulien päivityksiä on yhteensopiva nykyisten repositiory.

Mikä on uusi versio 0.6 Beta 3:

• Bugs liittyvät 0,6 serie on puhdistettu. Olimme uudelleenjärjestely tehdä selväksi 0,7 kehittämiseen.
• Tosiasia on, 0.7 on täysin uusi verrattuna 0,6, joten virheet eivät liity 0,6 pysäytetään.
• Siksi ainoa mitä voi tehdä on odottaa 0.7 alpha tulossa.
• Tarpeetonta sanoa bugeja raportteja on edelleen olemassa, ja pidämme huolen, ei toistamasta samoja virheitä 0,7.

vaatimukset

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment
• OpenGL