MACS2

Software kuvakaappaus:
MACS2
Ohjelmiston tiedot:
Versio: 2.0.10.20130731
Lähetyksen päivämäärä: 20 Feb 15
Kehittäjä: Tao Liu
Lupa: Vapaa
Suosio: 71

Rating: 4.0/5 (Total Votes: 2)

MACS2 on mallia, joka perustuu analyysiin työkalu ChIP-Seq tietoja.
Parannuttua sekvensointitekniikoilla, kromatiinia immunosaostus seuraa korkea suoritusteho sekvensointi (ChIP-Seq) on tulossa suosittu opiskella genominlaajuisten proteiini-DNA-vuorovaikutukset. Voit osoite puute voimakas ChIP-Seq analyysimenetelmä, esittelemme romaanin algoritmi, nimeltään Model perustuva analyysi ChIP-Seq (Mac), tunnistamiseksi opintosuoritusote sitoutumiskohdista. MACS kaappaa vaikutuksen genomin monimutkaisuuden arvioida merkitystä rikastettu ChIP alueiden ja Mac parantaa erotuskyky sitoutumiskohdista yhdistämällä tiedot sekä sekvensointi tag sijainti ja suunta. MACS voidaan helposti käyttää ChIP-Seq tietoja yksin tai kontrollinäytteessä kasvu erityisyyttä.

Vaatimukset :

  • Python

Vastaavia ohjelmistoja

edittag
edittag

20 Feb 15

MetagenomeDB
MetagenomeDB

12 May 15

pysam
pysam

14 Apr 15

Kommentit MACS2

Kommentteja ei löytynyt
Lisää kommentti
Ota kuvia!