PathVisio on avoimen lähdekoodin ja täysin ilmainen graafinen sovellus toteutettu Java-ohjelmointikielellä ja suunniteltu alusta asti käyttää näyttämiseen, analysointiin ja muokkaamiseen biologisia polkuja alle GNU / Linux-käyttöjärjestelmä system.Can käytetään piirtää reittejä , linkki biologinen entitiesThe ohjelmiston avulla käyttäjät voivat piirtää reittejä, linkki biologisten kokonaisuuksien (proteiineja tai geenejä) ja biologiset tiedot, käyttämällä tietokannan tunnisteita, muokkaa polkuja, sekä analysoida reittejä. Kanssa PathVisio voit myös pystyttävä kohdistamaan kokeelliset tiedot, kuten Mikrosiruanalyysi, ja visualisoida se päälle nykyisten reitin piirustus.
Lisäksi voit valita geenin tietokantaan valitsemalla metabolinen tietokanta, tarkastella tilastoja, tuonti ilme tiedot valitsemalla ilme aineisto, haku polkuja, näkymä legenda, manipuloida esineitä, tuonti hankkeita, sekä asentaa ja hallita plugins, mikä voi lisätä toimintoja app.Requires ei installationThe sovellus voi käyttää ilman sen asentamista GNU / Linux-käyttöjärjestelmän. Kaikki mitä sinun tarvitsee tehdä on ladata binary paketin Softoware, tallentaa arkiston haluamaasi paikkaan, pura se käyttäen arkiston johtaja apuohjelma, avaa uuttaa hakemisto, ja tuplaklikkaa pathvisio.jar file.Under hoodWhile ottaen vilkaista konepellin alle PathVisio ohjelmisto, me & rsquo; huomannut, että hakemus on kirjoitettu kokonaan Java-ohjelmointikielellä, ja että sen graafinen käyttöliittymä on suunniteltu uusimman Java Swing tekniikoita. Me & rsquo; ve onnistuneesti testattu sovellus tietokoneilla tukevat joko 32 tai 64-bittinen suoritin architectures.Runs tahansa käyttöjärjestelmä, jossa Java on supportedBeing kirjoitettu Java-ohjelmointikielellä, PathVisio voidaan julistaa alustasta riippumaton sovellus, joka tukee GNU / Linux Microsoft Windows, Mac OS X, BSD, Solaris ja muut käyttöjärjestelmän jossa viimeisin Java-teknologiaa tukevat.
Mitä uutta tässä julkaisussa:
- 31 tammikuu 2014: Virhekorjaus release
- GeneOntology ehdot poistetaan nyt hakutulosta Lisäysten
- DataNodes täytyy selvennettävä tunnus ja Tietolähde tai ei mitään (säästää tiedot solmut vain ID tai tietolähdettä ei ole sallittua enää)
Mitä uutta versiossa 3.1.2:
- Major bugi tiedoston tuonti moduuli kiinteä: http: //developers.pathvisio.org/ticket/1697
Mitä uutta versiossa 2.0.11:
- Autosave
- Zoom käyttäen vierityskiekolla
- valinta linjat on helpompaa: ei enää ole tarpeen klikkaa tarkka pikselin
- Nyt kaksi menetelmiä yliedustus analyysi; yhden jakson suuntautunut ja yksi data-suuntautunut
Mitä uutta versiossa 2.0.10:
- Uusi tapa piirustus pyöristetty suorakaide välttää venytysvaikutelma
- Erilaisia pieniä bugikorjauksia
Mitä uutta versiossa 2.0.9:
- Uusi liitin tyyppi liitin mielivaltaisen pituuden ja mielivaltainen kulmat
- Uusi & quot; solukomponentti & quot; omaisuuden säilytykseen biologinen merkitys osaston
- Uusi & quot; kaksinkertainen & quot; linja tyyppi (erityisen hyödyllinen kaksinkertaisen membraned soluelimiin)
- Klikattavat hyperlinkit väyliä
- katso virstanpylväs: & quot; milestone_27 & quot; täydellinen luettelo virheiden korjaukset
Mitä uutta versiossa 2.0.8:
- Parempi muotoja solukomponentteja
- Käytettävyysetuja parannuksia kuten copy / paste ponnahdusvalikosta
- katso virstanpylväs: & quot; milestone_26 & quot; täydellinen luettelo virheiden korjaukset
Mitä uutta versiossa 2.0.7:
- työkalurivin kuvakkeet ja uuden puolen paneeli helpottaa Valitse nuoli tyypit ja muodot (kiitos liubing)
- Reitti tietokantoihin sisältyvät tietolähteeksi, jotta voit lisätä linkkejä yhden jakson toiseen
- BioPAX muuttaja on parannettu ja tuottaa enemmän voimassa BioPAX asiakirjoja.
- uusi liitintyyppi, jossa yksittäiset kohdat voidaan manipuloida (kiitos leonth)
- määrä tietolähteitä on kasvanut yli 180
- katso virstanpylväs: & quot; milestone_25 & quot; täydellinen luettelo virheiden korjaukset
Mitä uutta versiossa 2.0.6:
- määrä ankkurit muoto voidaan lisätä default 12.
- legenda tietojen visualisointia voidaan nyt näytetään reitin kuvan itsestään. Aikaisemmin se oli vain näkyvä sivupaneeli.
- katso virstanpylväs: & quot; milestone_24 & quot; täydellinen luettelo virheiden korjaukset
Mitä uutta versiossa 2.0.4:
- parantanut tekstin muotoilun muotoja, tarrat ja datanodes
- paljon enemmän muotoja datanodes
- yksinkertainen pikselikoordinaateille
- asettaa taustaväri datanodes
Mitä uutta versiossa 2.0.3:
- Merkittävin tässä julkaisussa on uusi XML varten GPML reitin muodossa (versio 2010a). Tämä uusi reitti formaatti mahdollistaa monia uusia graafisia ominaisuuksia tulevaisuudessa, voit odottaa joitakin niistä esiintyy seuraavaan julkaisuun.
- Muita uusia ominaisuuksia:
- Invisible ankkureita todella näkymätön, ainakin silloin, kun jotain on liitetty niihin (Kiitos Margot)
- Extra -v komentorivioptiona (kiitos Mark)
- Valittu tietokanta näkyy oikein tilapalkilla uudelleen
- Monet uudet laajennus pistettä plugin kehittäjille
- katso virstanpylväs: & quot; milestone_21 & quot; täydellinen luettelo virheiden korjaukset
Mitä uutta versiossa 2.0.1:
- Parempi algoritmi automaattinen liittimet, jotka viittaavat ankkuri .
- Parempi piirustus nuolen tyyppejä, jotka on lyhyt & quot; kuilu & quot; lopussa.
- Koska Thawte Freemail palvelu on peruutettu, uusimme Tietoturva sertifikaatti
- Toteutustapa Historia katsoja oli vika, jos kunkin linjan katsottiin muutettu, vaikka se ei ollut. Tämä on korjattu.
Vaatimukset :
- Oracle Java Standard Edition Runtime Environment
Kommentteja ei löytynyt