QMForge hanke voidaan analysoida tuloksia Kvanttikemian (DFT) laskelmat. Gaussin 98/03, ADF, GAMESS (US), GAMESS (UK), PC-GAMESS, Jaguar, ja ORCA tiedostoja tuetaan (katso alla). Seuraavat analyysit ovat saatavissa:
· Mulliken Väestö Analysis (MPA)
· C-squared Väestö Analysis (SCPA)
· Päällekkäisyys Väestö Analysis (OPA)
· Mayerin Bond Tilaukset
· Lataa Hajoaminen Analysis (CDA)
· Fragmenttianalyysi
MPA, CSPA, ja OPA vaativat käyttäjän määrittelemä joukko palasia, ja tulostaa prosentin osuudet ne fragmentit, tekevät kohti kunkin molekyyliorbitaali molekyylin. Mayerin bond tilaukset laskee side tilauksia kunkin parin atomien molekyylin. CDA ja fragmentti analyysi vaativat kolme tai useampia laskelmia (yksi koko molekyylin, ja kaksi fragmentti laskelmat), sekä antaa tietoa liimaus välisestä vuorovaikutuksesta palasia.
QMForge on suora jälkeläinen PyMOlyze, joka innostui konsoli-pohjainen, (alun perin) Windows-only ohjelma AOMix joka on ominaisuuksia, kuten (ja lisäksi) edellä mainitut. Olen alun perin kirjoitti PyMOlyze koska halusin käyttäjäystävällisen (ts. Graafinen) Linux ohjelmaa tekemään MPA kunkin molekyyliorbitaali Gaussin laskelmia. Olen laajensi sitä käsittelemään tiedostoja geometriasta optimointeja koska löysin itseni haluavat voisin kääntää ja kiertää optimoidun rakenteen ja tallentaa että XYZ tiedosto. Nyt se on nimetty uudelleen QMForge, ja käytän sitä lähes kaiken paitsi tehdä molekyyliorbitaali kuvia ja kaavioita.
On vielä joitakin analyysejä, jotka QMForge ei tee, joten jos se ei tarpeitasi, tutustu AOMix (tai ampua minulle sähköpostia ja jutellaan).
QMForge on luotu käyttämällä Python scripting kieli, Qt4 työkalupakki ja sen python laajennukset PyQt4, Numeerinen, ja cclib compuational paketti jäsentämiseen kirjasto. Se on testattu Windows XP, Windows 2000, ja Mac OS X; sen pitäisi toimia yhtä hyvin tahansa GNU / Linux-jakelun, vaikka en ole testannut sitä vielä.
Mitä uutta tässä julkaisussa:
· Name muutos QMForge
· ORCA tuki
· Vaihda numpy 1.0.2 ja openbabel 2.1.1
· Käyttää cclib rakennettu 0,8 haara + julkaisematonta ORCA parser
Kommentteja ei löytynyt