IPod Application Installer II voi asentaa käynnistyslatainta, muokata loader.cfg tiedostoja, kopioida musiikkia pois iPodin, muuntaa elokuvia MPEG-4 (Eiter iPod, PSP, tai vain iTunes), asenna PZ2 moduulit, asenna iBoy, iDoom, iGameGear , korjata / tehdä...