CLC DNA Workbench

CLC DNA Workbench luo ohjelmiston ympäristö, jonka avulla käyttäjät voivat tehdä useita edistyneitä DNA-sekvenssin analyysit yhdistettynä sileä tiedonhallinta, ja erinomainen graafinen katselu ja tulostuslaitteet.
CLC DNA Workbench on saatavilla Windows-, Mac OS X ja Linux-alustoille.

Ominaisuudet

• bioinformatiikka ominaisuuksia in Gene Workbench :
• Joustava katselu pyöreitä molekyyleistä.
• Editor graafisesti ja algorithmically kehittyneet alukesuunnittelu
• Assembly of DNA-sekvenssin tietojen
• Molekyylikloonaus
• Automaattinen SNP merkinnästä sekvenssit
• Etsi ja löytö DNA kuvioita
• Paikallinen monimutkaisuus alueen analyysejä
• Käänteinen käännös proteiinin geenistä, joka perustuu käännös taulukoita lajimäärä
• Lisäasetukset restriktioentsyymianalyysin ja hallinta
• Dot juoni perustuu analyyseihin
• Matalat DNA tilastot lukien useita piirteitä tietyn molekyylin
• NCBI sekvenssidataa search
• Pääsy www info PubMed
• Muut bioinformatiikka ominaisuuksia:
• DNA, RNA ja proteiinisekvenssi editori näytetään sekä lineaarisia ja pyöreä molekyylejä
• DNA, RNA ja proteiini linjaus editor
• Interaktiiviset logot molemmin DNA, RNA ja proteiini linjaukset
• Eräprosessointi analyysien useita jaksoja yksi teos askel
• Motif search
• Pattern Discovery (Tuntematon kuvioita)
• Lisäasetukset uudelleen linjaus ja korjaa-pisteen kohdistus vaihtoehto
• Sarjakuvaus logo kaavioita pitkin DNA, RNA ja proteiini linjaukset
• Manuaalinen merkinnästä sekvenssit
• Integrated PubMed haut
• Web-pohjainen järjestyksessä hakua käyttämällä BLAST
• Dot juoni perustuu analyyseihin
• Paikallinen monimutkaisuus alueen analyysit ja monimutkaisuuden tontteja
• Gap jae kaaviot
• G / C sisällön analysointi ja kuvaajat
• Projektin ja tiedonhallinnan:
• Täysi integrointi tietojen syöttö, tiedonhallinta, laskentatulokset, ja tietojen vienti
• Yksityiskohtainen loki
• Kaikki tiedostot voivat tallentaa paikallisiin hankkeisiin, ja käynnisti ohjelmasta
• Tuonti ja vienti tietojen useita tiedostomuotoja
• Valitse työskennellä useissa työtilaa kerrallaan, mahdollistaa samanaikaisesti käsitellä useita projekteja
• Tuo jäljittää tiedostoja ja laatua pisteiden automaattisella DNA sequening käyttävien koneiden Standard Chromatogram Format, ABI formaatit ja PHD-muodossa (PHRED)
• tarkastelu ja raportointi:
• Lisäasetukset BLAST view
• Lisäasetukset kaavioiden näkymä
• Lisäasetukset histogrammi view
• Lisäasetukset pistekuvaajan näkymä
• Etsi ominaisuudet sekvenssit ja linjaukset

vaatimukset

• 256 Mt RAM-muistia tarvitaan
• 512 Mt RAM-muistia suositellaan
• 1024 x 768 näyttö suositeltava

rajoitukset

• 4 viikon täysin toimiva demo