GENESIS (lyhyt yleiseen hermostoputken Simulation System) on yleiskäyttöinen simulaatio alustan, joka on kehitetty tukemaan simulointi neurojärjestelmät vaihtelevat subsellulaariset komponenteista ja biokemiallisia reaktioita monimutkaisiin malleja yhden neuronien, simulaatioita suurissa verkoissa, ja järjestelmät- tason malleja.
GENESIS on tarjonnut perustan laboratorion kursseja hermo simulointi Caltech, Marine Biological Laboratory, Kreeta, Trieste, Bangalore, ja Obidos lyhytkursseja Computational Neuroscience, ja vähintään 49 yliopistoissa, joista olemme tietoisia.
Useimmat nykyiset GENESIS sovellukset sisältävät realistisia simulaatioita biologisten neurojärjestelmät. Vaikka ohjelmisto voi myös mallintaa enemmän abstrakteja verkot, muut simulaattorit ovat sopivampia backpropagation ja vastaavia konnektionististen mallinnus.
Asennus
1. Valitse paikka, johon haluat asentaa "Genesis" hakemistopuuhun. Jos teet koko järjestelmän asennuksen "root" käyttäjä, / usr / local on hyvä valinta. Henkilökohtaisen asennuksen ilman pääkäyttäjän oikeudet, voit käyttää kotihakemiston ("~"). Vaihda tähän hakemistoon ja pura Genesis hakemiston arkistotiedoston genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. Esimerkiksi,
cd / usr / local
terva xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
tai minne olet sen (esim ~ / downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz).
2. Vaihda "Genesis" hakemistoon ja suorita asennus-skripti, joka luo ".simrc" GENESIS alustus tiedosto ". Kopioi .simrc kotihakemistoosi.
cd genesis
./binsetup
cp .simrc ~
3. Finallly, lisätä Genesis hakemisto hakupolun, niin että "genesis" löytyy hakemiston, että olet. Jos tunnuksesi kuori on bash, voit tehdä tämän muokkaamalla Bashrc tiedostoa kotihakemistossasi Lisää rivi
PATH = $ PATH: / usr / local / genesis
lopussa tiedoston. Jos käytät tcsh tai csh kuin komentotulkin, lisää
set path = ($ path / usr / local / Genesis)
teidän .tcsh tai .csh tiedostoa.
Tässä vaiheessa olet valmis kokeilla GENESIS. Muuttuvat hakemistoon synnystä / Scripts ja yrittää joitakin tutorials ehdotti README-tiedosto.
Mikä on uusi tässä julkaisussa:
- Lukuisat bugikorjauksia ja parannuksia.
Kommentteja ei löytynyt