MacVector on kattava Macintosh-sovellus, joka tarjoaa sekvenssinmuokkauksen, pohjamallin, internet-tietokannan etsinnän, proteiinianalyysin, sekvenssin vahvistuksen, monisekvenssin kohdistuksen, filogeenisen rekonstruoinnin, koodausalueen analyysin ja monenlaisia muita toimintoja. MacVectoria pidetään yleisesti intuitiivisena, helppokäyttöisenä ohjelmana, jota voidaan käyttää sekvenssianalyysiin.
Mitä uutta on tässä versiossa:
Jotkin vähäiset kohdat,
Uutta versiossa 16.0.6:
Jotkin vähäiset kohdat, joiden kohdalla on viittaus, kun lukee kohdistetut alkavat viimeisen pyöreän sekvenssin jäännöksestä, on korjattu.
Uutta versiossa 16.0.2:
Ristiriitaa kohdistettaessa OS X 10.7: n ja OS X 10.8: .
Kun viet sekvenssin GenBank-muodossa, MacVector kirjoittaa nyt kaikki GenBank-ominaisuudet, vaikka ne ovat nykyään vanhentuneita.
Uutta versiossa 15.5.4:
Restriktioentsyymien kaksoislähetysteho toimii nyt odotetulla tavalla, kun vain kaksi tai kolme entsyymiä on valittu.
Uutta versiossa 15.1.4:
3/6-kehyksen käännös yhdellä sekvenssineditorilla ylläpitää kehystä oikein
rivinvahvistuksen jälkeen.
Ongelma, kun käynnistät 3/6-kehyksen käännöksen kohdistimessa Vertailuviite editorissa a
sekvenssin, joka on yli 65 000, on korjattu.
Uutta versiossa 15.1.3:
Multiple Sequence Alignment Editorissa on korjattu virhe . Tämän vian vaikutuksena oli, että ylimääräiset jäännökset ilmestyivät joskus sekvenssien alkaessa, kun ne tallennettiin. Tämä vaikutti vain muokatuihin MSA-asiakirjoihin. Jos kohdistit vain ClustalW / Muscle / T-Coffee ja tallennat ilman editointia, kohdistukset ovat oikeita.
Uutta versio 15.1.1:
Ristiriitaa tallennettaessa tiettyä muokattua monikertaistutusta
(.msan, .msap) asiakirjat on ratkaistu.
Uutta versio 14.5.3: p>
Satunnaiset kaatumiset Align to Folder -toiminnossa on korjattu.
Uutta versiossa 14.5.2:
Kohdista kansioon nyt käsittelee oikein haut käyttämällä segmentti, joka ylittää pyöreän alkuperän.
Kartan asetusten automaattinen uudelleen etsiminen päälle ja pois päältä päivittää kaikki avoimet ikkunat oikein.
Uutta versio 14.0:
Suorituskyvyn lisäksi, kun työskentelet suurien sekvenssien ja kohdistusten kanssa, on olemassa merkittäviä parannuksia alustakäsittelyyn (mukaan lukien alustapohjaisten tietokantojen tuki) ja NGS-dataa.
Uutta versio 13.5.5:
Ongelma, jossa tyypin ominaisuudet "????" luodaan avattaessa kohdennetun viivakoodin (.axml) tiedosto avautuneena.
Uutta versio 13.5.3:
- Contig-editorin näyttö päivittyy nyt oikein OS X 10.6: ssa ladatessasi tallennettua kohdistusta.
- Proteiinianalyysityökalussa on korjattu kaatuminen.
- Quicktest Primer -liitännän kaatuminen työskennellessä suuren joukon restriktioentsyymejä on korjattu.
Uutta versio 13.5.2:
Contig Editorissa / Align to Reference Editorissa vieritysongelma on ratkaistu. Harvinainen kaatuminen, kun herääminen eri verkossa on korjattu.
Uutta versio 13.5.1:
- OS X 10.6: ssa tuodut sekvenssit säilyttävät alkuperäisen tiedostonimensä.
- Ajoittaiset salasanan muokkaamattomat sekvenssit, joita ei ole tallennettu, on korjattu.
- Merkittyjen tekstien käännökset nyt kunnioittavat oikein asetusten lippuja.
- Jotkut epäjohdonmukaisuudet "nimettömien" sekvenssien numeroinnissa on ratkaistu.
- Ongelma, jossa järjestysikkunat katoaisivat OS X 10.6 -käyttöjärjestelmässä, on ratkaistu,
- Näyttöongelmia on kohdistettu Align to Reference -editorissa.
- Ongelma, jossa käännökset puuttuivat joskus Kartta-välilehdestä, kun zoomaus on täynnä.
- Mahdollisuus tuoda BAM-tiedostoja Assembler-projektiin on palautettu.
- Nukleiinihapon useita kohdistusasiakirjoja on nyt oma väriryhmä ja estävät oletusarvot.
- Primer-mallin "Test PCR Primer Pair" -periaatteet voivat nyt olla yli 35 nt pitkä.
- Tekstinäkymät muuttavat automaattisesti leveyden automaattisesti, jotta ne tulisivat yhdelle sivulle.
Uutta versiossa 13.5:
Grafiikka Symbol Editor ja kelluva Graphics Palette on kirjoitettu uudelleen, kun MacVector on siirtynyt 64-bittiseen arkkitehtuuriin (johtuen MacVector 14.0: sta). Muita tärkeimpiä parannuksia on pyritty parantamaan seuraavien sukupolvien sekvensointi (NGS) -tiedostojen käsittelyä, erityisesti Align To Folder ja Assembler Velvet de novo kokoonpanotoiminnolla. On myös ollut joitain koodin optimointia, jotta voidaan käsitellä paremmin suurien genomisten sekvenssien analyysiä, erityisesti havaittavissa Pustell Matrixin "dot-plot" -toiminnolla.
Kommentteja ei löytynyt