Software kuvakaappaus:
Ohjelmiston tiedot:
Miso (isoformien seos) on todennäköisyyksiin puitteet kirjoitettu Pythonilla että kvantitoi ilmentymistasoon & nbsp; vaihtoehtoisesti liitettyjä geenien RNA-Seq tietoja, ja yksilöi eri tavoin säännelty isomuotoja tai eksoneissa poikki näytteitä.
Mallintamalla generatiivisten prosessi, jossa lukee tuotetaan isomuotojen RNA-Seq, MISO malli käyttää Bayesin päättely laskea todennäköisyys, että luku- peräisin tietystä isomuodon.
Miso käyttää johdettua jakamisesta lukee isomuodot kvantitoimaan runsaus taustalla joukko vaihtoehtoisia mRNA isomuotojen. Luottamusvälit yli arvioita voidaan saada, mikä määrällisesti lukujen luotettavuuteen.
Katso http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ varten MISO oppaat ja dokumentointi.
Vaatimukset :
- Python
Kommentteja ei löytynyt