FlexS ennustaa rakenne ja suunta yhden ligandien suhteessa toinen. In FlexS viite-ligandi oletetaan olevan jäykkä, jolloin se on annettava konformaatiossa, joka on samanlainen sidottu tilaan. Päällekkäisyys algoritmi FlexS vaatii vain vähän manuaalista. Voit integroida tämä tietämys laskelmat kanssa FlexS suorittamalla yhden askeleen manuaalisesti. Siten, FlexS on suunniteltu interaktiivinen työn ligandiparien sekä ligandin perustuvat virtuaaliset seulonta. Kaksi tärkeimmät sovellukset FlexS ovat ligandin Super paikannus (esim. For CoMFA / QSAR) ja virtuaaliseulonnan. Jos on proteiinia ja pieni molekyyli sen sitominen (ns viite-ligandi), mutta ei proteiinin rakenne, voidaan ottaa viite rakenne negatiivisena sormenjälki aktiivisen. FlexS määrittää samankaltaisuuden testi ja referenssirakenne kohdistamalla niitä. Vuonna virtuaaliseulonnan, sinulla on viite-ligandin ja joukko yhdisteitä ja olet kiinnostunut priorisoinnissa yhdisteitä kokeelliseen testaukseen.
Kommentteja ei löytynyt