MacMolPlt on kemian visualisointi työkalu, joka voidaan rakentaa molekyylejä, joissa on integroitu graafisen mallin rakentaja, luoda tulo tiedostoja GAMESS laskennallisen kemian ohjelma, ja sitten visualisoida tuloksia laskennallisen kemian ajoja. Ominaisuuksiin kuuluu laadukkaita 3D-näyttö, animaatioita normaalin liikennemuotojen ja reaktiosarjoilla ja lähtö eri formaatteihin kuten laadukkaita kuvia ja QuickTime ja Flash-elokuvia.
- Input avulla:
- MolPlt tiedostomuoto lävistettyjä ulos GAMESS
- esittäjä pasting suorakulmaiset koordinaatit miltään GAMESS tai Gaussin lokitiedosto
- tahansa GAMESS tulo, kirjaudu tai irc-tiedosto
- Xmol tyylin XYZ tiedosto
- Molden tiedostoja
- Protein Data Bank (ATE ) tiedosto
- Chemical Markup Language (KML) tiedostoja
- Rakenna graafisesti interaktiivinen molekyyli editor
- Rakenna käsin cartesian tai Z-matriisi tyylillä sisäiset koordinaatit
- 3D-näytön rakenteen ja normaalitilaan
- Animaatio normaalimoodit.
- 3D reaaliaikainen kierto ja käännöksen hiiri ohjaus
- laskeminen tahansa Z-matriisi parametri
- Visuaalisesti toimenpide / näyttö etäisyydet, kulmat ja dihedrals.
- Automaattinen luominen lineaarinen pienimmän Motion (OTK) polut
- 2D ja 3D laskenta ja näyttö:
- Molecular orbitaalit (AO: n, MO: n tai LMO: n)
- Yhteensä elektronitiheys
- tiheyserot
- Molecular sähköstaattiset potentiaalit (MEPMaps)
- Basic syötetiedosto generaattori GAMESS
- OpenGL käytetään laadukkaita 3d
- Tuki molekyyli- symmetria
- Luo symmetria riippuvainen atomien
- Määritä symmetria ainutlaatuinen atomia
- Automaattisesti määrittää lista tuetuista pisteen ryhmien koordinaatistossa.
- Kierrä koordinaatit oikea periaate suunta
- Näyttö symmetria toimijoiden monta pisteryhmät
- Julkaisu jälkeä (väri tai mustavalkoinen) kautta suoratulostukseen Kopioi ja liitä toiseen sovellukseen.
- Output erilaisissa muodoissa kuten Windows bittikartta, JPEG, PNG, KML XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Elokuvat ja QuickTime-elokuvia.
Mitä uutta tässä julkaisussa:
Useita parannuksia on tehty näytön koodin. Vaihtoehdot on lisätty 3D-osio prefernces sujuvan varjostuksen kanssa ja ilman varjoja.
Lisätty alkeellisia tuki Mopac tiedostoja.
Lisätty mahdollisuus vaihtaa näkyvyyttä alunalkaen, MM, ja EFP atomeja.
Parannettu tuki Malli Core Potentials.
Lisätty koukku tulo rakentaja uuden GAMESSQ ohjelma.
Parannettu ATE tiedosto jäsennin.
Kommentteja ei löytynyt