Avaa Babel on avoimen lähdekoodin, yhteistyöhön, vapaa ja multiplatform kirjasto-ohjelmisto, joka on suunniteltu toimimaan kemiallinen työkalupakki erityisesti suunniteltu tunnistamaan lukuisia kieliä kemiallisia tietoja. Se on yksinkertaisesti puhuttu & ldquo; Open Chemistry Toolkit. & Rdquo; Ominaisuudet glanceWith Open Babel, käyttäjät voivat etsiä, analysoida, muuntaa, ja tallentaa tiedot kemiasta, molekyylimallinnuksen biokemia, sekä muut asiaan liittyvät alueet. Se tukee erilaisia tavallisia kemiallisia tiedostomuotoja, kuten MOL2, SDF / MOL, ATE, XYZ, hymyilee, ja KML.
Lisäksi Open Babel tarjoaa täysin varustellun ohjelmoijan työkalupakki, kemiallinen MIME tukea, SMARTS haussa, joustavat atomi / bond typer, vedyn poisto ja lisäksi bitvector luokka, matriisi ja vektori muutoksia sekä molekyyli- testi suite.Under huppu ja Tuetut käyttöjärjestelmät systemsOpen Babel on kirjoitettu kokonaan C ++ ohjelmointikielellä. Se & rsquo; sa totta cross-platform-ohjelmisto, joka tukee GNU / Linux, BSD, Solaris, SGI, Microsoft Windows ja Mac OS X käyttöjärjestelmissä. Sekä 32-bittinen ja 64-bittiset tietokoneet virallisesti tuettu kirjoitettaessa this.Getting alkoi Open BabelFirst kaikki, suosittelemme asentamaan Open Babel käyttämällä valmiiksi rakennettu binääripaketit default asennuslähteet teidän Linux-jakelu. Jos GNU / Linux-järjestelmän doesnt & rsquo; t on Open Babel ohjelmisto sen repot, niin Käytät ll on koota ja asennus sovellus käyttää universaali lähteitä arkistoida tarjotaan Softoware.
Lataa pakettia (tar.gz arkisto), pura se haluamaasi paikkaan, avaa pääte-emulaattori, siirry uuttaa kansioon ja suorita & ldquo; cmake. & Rdquo; komento (ilman lainausmerkkejä) määrittää hankkeeseen. Sitten sinun täytyy ajaa & ldquo; tehdä & rdquo; komento, ilman lainausmerkkejä tietenkin koota sitä. Varmista, että CTee työkalu asennettu käyttöjärjestelmä ennen edellä ohjeita.
Mitä uutta tässä julkaisussa:
- Tämä julkaisu on merkittävä bug-fix-versiosta ja se pitäisi olla vakaa päivitys, suositellaan kaikille käyttäjille avoimen Babel. Monia bugeja ja parannuksia on lisätty viime vuodesta 2.3.0 julkaisu.
Mitä uutta versiossa 2.2.2:
- Tämä julkaisu on merkittävä bug-fix release ja on vakaa päivitys, suositellaan kaikille käyttäjille avoimen Babel. Vaikka saattaa olla monia uusia ominaisuuksia, monia kaatumisia ja muita vikoja on korjattu vuodesta 2.2.1.
- päivitetty uuteen InChI 1,02 julkaisu tuottaa standardoituja InChI ja InChIKey lähtö.
- Kiinteät monet stereokemiaan lukuvirheitä / kirjoittaminen hymyilee. Tämä on osa laajempaa hanketta, joka valmistuu 2.3 julkaisu.
- Kiinteät kokoaminen ja asennus Cygwin ja MinGW alustoille.
- Merkittävästi parantunut aromaattisuuteen ja Kekule side harjoitustyö.
- Parempi 2D - & gt; 3d koordinoida sukupolvi
- Parempi koordinoida tuottamalla --gen3d komentorivin käytön
- Parempi suorituskyky koordinoida sukupolvi.
- Uusi --fillUC komentorivin operaation Babel.
- Korjauksia riippuu pH vedyn lisäksi.
- Lisätty tuki lukemiseen värähtelyjen tietojen Molden, Molpro ja NWChem Tulostiedostot.
- Päivitetty Atomic säteille viime teoreettiset laskelmat.
- Kiinteä vika lukiessa gzip-pakattu MOL2 tai XML-tiedostoja.
- Sulje tiedostoja virheen jälkeen. Korjaa vian kanssa Pybel jossa tiedostot olisivat auki.
- Monet enemmän korjauksia ja pieniä ominaisuus parannuksia. == Uudet tiedostomuodot == Import & Export:
- Molpro tulon ja lähdön.
- VASP koordinoida tiedostoja (CONTCAR ja POSCAR).
Mitä uutta versiossa 2.2.1:
- Parempi scripting rajapintoja, kuten Python 3 tuki ja parannettu Java ja C # tukea.
- Lisätty tuki MACCS sormenjälkiä. Kiitos RDKit hankkeeseen.
- Monet korjauksia ja parannuksia voimakenttä koodin. Erityisesti UFF voimakenttä täytäntöönpanon pitäisi käsitellä paljon enemmän molekyylejä.
- Parannettu 3D koordinoida sukupolvi, erityisesti renkaan palasia. Voit antaa tämän kokeilla kanssa obgen apuohjelma.
- Kiinteä erilaisia ATE tuonti virheitä atomityyppejä.
- Lisätty tuki lukemista maksut ja säteille PQR tiedostomuotoja.
- Lisätty tuki lukemista ja kirjoittamista yksikkö solujen ATE muodoissa.
- Uusi & quot; lähtö & quot; tiedostomuoto ottaen geneeristen & quot; .out & quot ;, & quot; .log & quot ;, ja & quot; Dat & quot; tiedostoja ja lukeminen sopivilla tiedoston tyypin sisällöstä. Tällä hetkellä toimii erittäin hyvin kvanttikemiaa paketteja.
- Lisätty parannettu virheiden käsittelyä ja raportointia, kun voi ladata tiedostomuotoja.
- Parempi CIF tiedostomuotojen tuki.
- Monet, monet, monet muita korjauksia ja pieniä parannuksia.
Kommentteja ei löytynyt