Ylin Bioinformatiikka Varten Linux

AHREA on OHJELMISTO sarja, joka auttaa löytämään Suhteellinen Expression Learners helppoa. Se on kirjoitettu Pythonilla. vaatimukset ...

Arem on perustuu MACS (malli Based Analysis ChIP-Seq data).High-throughput sekvensointi kytketty kromatiinin -immuunoelektroforeesin sateeseen (ChIP-sekvenssi), on laajalti käytetty karakterisoimiseksi genominlaajuisten sitoutumismalleja...

CWC Simulator on C ++ täytäntöönpanoa CWC, hammaskivi edustus ja simulointi biologisten järjestelmien. & Nbsp; Onnistuneen asennuksen jälkeen (katso ASENNUS) voit ajaa simulaatioita yli CWC mallia, kuten on esitetty joitakin esimerkkejä (katso esimerkit...

Syntainia on innovatiivinen sovellus visualisointiin useita genomien. & Nbsp; Se esittelee yksinkertaisen ja intuitiivinen käyttöliittymä katsella ja käsitellä suhteita geeniryhmien. Selkeämpi geeniä visualisointi, se on helpompi tutkijan tunnistaa...

checkmyclones on ohjelmisto, joka tarjoaa työkaluja tarkistaa Sanger sekvensointitulokset & nbsp; (tai pelkkää tekstiä tai FASTQ tiedostot) vastaan ​​joukko viitesekvenssit, toimitetaan kaikki kohtuulliset muodossa (myös koordinaatit). vaatimukset ...

tigreBrowser on geenien ilmentyminen malli selain tuloksia tigre R paketti (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Asennus: tigreBrowser vaatii Python versio> = 2.5. tigreBrowser voidaan asentaa komennolla:python setup.py...

picme on Python paketti, joka sisältää ohjelmia arvioida ja juoni phylogenetic informatiivisuus suuria aineistoja. asennus Tällä hetkellä helpoin tapa asentaa ohjelma on:git klooni git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / path / to / picmeVoit...

tapiiri on Python työkalu, joka sisältää ohjelmia arvioida ja juoni phylogenetic informatiivisuus suuria aineistoja. siteeraavat tapir Kun käytät tapiiri, ota mainita:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir mahdollistaa suurikapasiteettisten analyysi...

toimiin paketti tarkka stokastisen simuloinnin reaktio-diffuusio järjestelmien mielivaltaisesti monimutkaisia ​​3D geometriaa. Meidän sydänsimulaation algoritmi on täytäntöönpano Gillespien SSA laajennettu käsittelemään diffuusion molekyylien yli...

NEO (Neural Ensemble Objects) ja on projekti antaa yhteiset perusluokat käytettäväksi hermo data-analyysi, jonka tavoitteena on saada OpenElectrophy, NeuroTools ja ehkä muita hankkeita, joilla on samankaltaisia ​​tavoitteita enemmän lähekkäin.Kaksi...