Täytyy olla Bioinformatiikka Varten Linux
ProteinShop on interaktiivinen työkalu manipuloimalla proteiinirakenteita. Se on suunniteltu nopeasti luoda joukon proteiinin kokoonpanoissa käyttäen ihmisen tiedon ja intuition. Nämä kokoonpanot voi altistaa paikallisten tai maailmanlaajuisten...
pyNetConv on Python kirjasto luotu auttamaan muuntaminen joidenkin verkon tiedostomuotoja.Koska version 0.6, pyNetConv pystyy lukea / kirjoittaa (ja muuntaa /) seuraavat...
Pysam on Python-moduuli lukemiseen ja manipuloimalla Samfiles. & Nbsp; Se on kevyt kääre samtools C-API.Pikaopas on täällä. Tarkemmat asiakirjat on saatavilla täältä.Kysymykset ja kommentit ovat erittäin tervetulleita, ja olisi lähettää pysam...
PySCeS on projektin kehittämä Triple-J-ryhmän molekyylilääketieteen solufysiologian & nbsp; yrittääkseen malli ja ymmärtää monimutkaisia prosesseja ja järjestelmiä, jotka muodostavat elävän solun. Ominaisuudet : tekstipohjainen mallin kuvaus...
reciprocal_smallest_distance on pairwise orthology algoritmi, joka käyttää maailmanlaajuisesti sekvenssirinnastuksen ja suurimman uskottavuuden evolutiivisen etäisyys sekvenssit tarkasti havaitsee ortologeille välillä genomien. Asentaminen tarpaketin...
RFLP planner on työkalu, joka auttaa suunnittelemaan RFLP kokeilu: Se toteaa restriktioentsyymejä että leikattu joukko homologin DNA-sekvenssien eri tavoin ja simuloi saatu geeli elektroforeesin kuvan. Ohjelma auttaa sinua löytämään ratkaisevaa...
Seal on Python-moduuli, joka tarjoaa sekvenssirinnastuksen päällä Hadoop.Seal on MapReduce hakemus biologisen sekvenssirinnastuksen. Se toimii Hadoop (http://hadoop.apache.org) kautta Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), Python MapReduce ja HDFS API...
seriesoftubes on laajennettu kaasuputken Solexa ChIP-seq tietoja.Pakkaus Documentation
Vaatimukset :
...
Build-järjestelmissä, kuten make käytetään usein luomaan monimutkaisia työnkulkuja, esim bioinformatiikan. & nbsp; snakemake pyritään vähentämään monimutkaisuutta luoda työnkulkuja tarjoamalla puhdas ja moderni verkkotunnuksen erittely, kieli (DSL)...
SSuMMo on kirjaston toimintoja suunniteltu noin iteratiivisesti HMMER määrittää sekvenssien taksonien. & Nbsp; tulokset ovat erittäin selityksineen Puissa laji / suvun jakautuminen yhteisön.Ohjelmat mukana lähdekoodin sisältävät työkaluja: -- Rakenna...
