Ghemical on laskennallisen kemian ohjelmistopaketti julkaistu GNU GPL. Se tarkoittaa, että täyden lähdekoodin paketti on saatavilla, ja käyttäjät voivat vapaasti tutkia ja muuttaa paketin. Ghemical on kirjoitettu C ++.
Ghemical hanke on graafinen käyttöliittymä (joka perustuu GNOME), ja se tukee sekä kvantti-mekaniikka (semi-empiirinen ja ab initio) malleja ja molekyylimekaniikka mallit (on kokeellinen Tripos 5,2-kuin voimakenttä luonnonmukaisen molecu myös työkalu alennettua proteiinin mallit [1] on mukana. geometria optimointi, molekyylidynamiikka ja suuri joukko visualisoinnin työkalut ovat tällä hetkellä saatavilla.
Ghemical vetoaa ulkoiseen koodin tarjoamaan kvanttimekaniikkaan laskelmat. Semi-empiirisiä menetelmiä MNDO, Mindo / 3, AM1 ja PK3 tulevat MOPAC7 paketti (Public Domain), ja ne sisältyvät lähde jakelussa.
MPQC paketti (GNU GPL) käytetään antamaan alun perin menetelmät: menetelmät perustuvat Hartree-Fock teoria tällä hetkellä tuetaan perusteella sarjaa vaihtelevat STO-3G 6-31G **.
MPQC koodia ei sisälly lähde jakeluun. Jotta voit käyttää MPQC-pohjainen ab initio menetelmien Ghemical, sinun täytyy ensin kääntää ja asentaa MPQC ohjelman järjestelmään, ja sitten koota Ghemical käyttämällä joitakin erityisiä asetuksia, jotka viittaavat ohjelmat yhteen; Katso INSTALL tiedosto lisätietoja. Ghemical sisältää myös OpenBabel paketti tuontiin ja vientiin useita eri tiedostomuotoja (sekä muut tehtävät).
Asennus
Kun olet ladannut uusimman version, sinun pitäisi purkaa kaikki tiedostot arkistosta tiedoston "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz" tai vastaavasti "gunzip ghemical-1.00.tgz; terva -xvvf ghemical-1.00.tar". Tämän jälkeen lue "Install" -tiedoston juuri uuttaa saada lisätietoja.
Mitä uutta tässä julkaisussa:
Kommentteja ei löytynyt