Paras Bioinformatiikka Varten Linux

Adun Hanke on laajennettavissa biomolekyylitason simulaatio ohjelma, joka sisältää tiedon hallintaan ja analysointiin.Adun tarjoaa kehittyneitä algoritmeja ja protokollat ​​molekyyli simulointi pääsee intuitiivinen käyttöliittymä, mutta myös joustavampaa...

MacMolPlt on nykyaikainen grafiikka ohjelma piirtämistä 3-D molekyylirakenteet ja normaalimoodit (tärinä)....

massXpert massaspektrometria paketti on massaspektrometriaa ympäristön lineaarisille (bio-) polymeerien. Se perii kaikki innovaatiot GNU polyxmass, koska se on satama, joka hanke cross-platform kehitysympäristö. Mikä on uusi tässä julkaisussa: ...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) on tehokas ohjelma, joka tasaa suhteellisen lyhyt nukleotidisekvenssit vastaan ​​pitkä referenssijakson kuten ihmisen genomin.Ohjelmisto toteuttaa kaksi algoritmeja, BWA-lyhyt ja BWA-SW. Entinen teokset tutkittaessa...

goby on Python API lukemiseen binaaritietoja tiedostoja käyttäen Merisää next-gen tietoja hoitosuunnitelmaa.Normaalisti tämän hakemiston tulee osana täydellisen Merisää paketti, saatavilla:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Täydellinen paketti sisältää...

MACS2 on mallia, joka perustuu analyysiin työkalu ChIP-Seq tietoja.Parannuttua sekvensointitekniikoilla, kromatiinia immunosaostus seuraa korkea suoritusteho sekvensointi (ChIP-Seq) on tulossa suosittu opiskella genominlaajuisten...

PySCeS on projektin kehittämä Triple-J-ryhmän molekyylilääketieteen solufysiologian & nbsp; yrittääkseen malli ja ymmärtää monimutkaisia ​​prosesseja ja järjestelmiä, jotka muodostavat elävän solun. Ominaisuudet : tekstipohjainen mallin kuvaus...

STEME Hanke alkoi elämä lähentämistä Odotus-maksimointi algoritmi sopivaa mallia käytetään motiivi etsijöitä kuten MEME.STEME & rsquo; s EM lähentämisestä toimii kertaluokkaa nopeammin kuin MEME toteutus tyypillinen asetukset. STEME on nyt kehittynyt...

SyntenyMiner on sovellus visualisoida ja kuulustella vertailuja joukossa useita täydellisiä genomisekvenssejä. Käyttöliittymä tarjoaa purjehduskelpoinen näkymä otteluita viite genomisekvenssin. Sekvenssin väliset ottelut kromosomit eri genomeja voidaan...

NetAtlas on Cytoscape plugin, joka käyttää kudosten geenien ilmentyminen tietojen suodattaa matkapuhelinverkon signalointiverkkoon. NetAtlas tunnistaa kudoksen määritelty verkot, kudosspesifisiä verkon osat, ja osat, joilla korreloitu ilme kudosten...