Paras Bioinformatiikka Varten Linux
Genepidgin on kokoelma Python työkaluja, jotka auttavat arviointia ja toimeksianto geenin tuotenimet. & Nbsp; On kolme pääkomponenttia:genepidgin * siivooja *& Nbsp; yhtenäistää geeni nimet per UniProt Nimeämisohjeetgenepidgin * vertailla *& Nbsp; vertaa...
toimiin paketti tarkka stokastisen simuloinnin reaktio-diffuusio järjestelmien mielivaltaisesti monimutkaisia 3D geometriaa. Meidän sydänsimulaation algoritmi on täytäntöönpano Gillespien SSA laajennettu käsittelemään diffuusion molekyylien yli...
TRMiner on Python apuohjelma, joka tähtää tieteellisen tiedon kuraattorit. & Nbsp; Sen avulla voidaan nopeasti karsia suuria kokoelmia tieteellisiä julkaisuja lauseita asiaan tietyn kaivos tavoite.Tämä saavutetaan kahdessa vaiheessa. Ensinnäkin tekstit...
Bioinformatiikka Benchmark-järjestelmä on yritys rakentaa kohtuullisen testaus puitteet, testejä ja tiedot, jotta loppukäyttäjät ja toimittajat koetin hoitavat järjestelmiä.Mitä me yritämme tehdä on luoda puitteet testausta, ja ydinjoukko testit, jotka...
Staden Package on täysin kehittynyt joukko DNA-sekvenssin kokoonpano (Gap4), editointi ja analyysityökalut (Spin) Unix, Linux, MacOSX ja MS Windows.On Gap4 edessä on tehty useita pieniä liittymällä liittyviäparannuksia miten tulokset yhtyy Etsi sisäinen...
Arem on perustuu MACS (malli Based Analysis ChIP-Seq data).High-throughput sekvensointi kytketty kromatiinin -immuunoelektroforeesin sateeseen (ChIP-sekvenssi), on laajalti käytetty karakterisoimiseksi genominlaajuisten sitoutumismalleja...
seriesoftubes on laajennettu kaasuputken Solexa ChIP-seq tietoja.Pakkaus Documentation
Vaatimukset :
...
MetagenomeDB on Python kirjasto on suunniteltu helposti tallentaa, hakea ja huomautuksia metagenomic sekvenssit. & Nbsp; MetagenomeDB toimia abstraktio kerros päälle MongoDB tietokannan. Se tarjoaa API luoda ja muokata ja yhdistää kaksi eri esineitä, eli...
Seal on Python-moduuli, joka tarjoaa sekvenssirinnastuksen päällä Hadoop.Seal on MapReduce hakemus biologisen sekvenssirinnastuksen. Se toimii Hadoop (http://hadoop.apache.org) kautta Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), Python MapReduce ja HDFS API...
Miso (isoformien seos) on todennäköisyyksiin puitteet kirjoitettu Pythonilla että kvantitoi ilmentymistasoon & nbsp; vaihtoehtoisesti liitettyjä geenien RNA-Seq tietoja, ja yksilöi eri tavoin säännelty isomuotoja tai eksoneissa poikki...
