Paras Bioinformatiikka Varten Linux

MetagenomeDB on Python kirjasto on suunniteltu helposti tallentaa, hakea ja huomautuksia metagenomic sekvenssit. & Nbsp; MetagenomeDB toimia abstraktio kerros päälle MongoDB tietokannan. Se tarjoaa API luoda ja muokata ja yhdistää kaksi eri esineitä, eli...

SSuMMo on kirjaston toimintoja suunniteltu noin iteratiivisesti HMMER määrittää sekvenssien taksonien. & Nbsp; tulokset ovat erittäin selityksineen Puissa laji / suvun jakautuminen yhteisön.Ohjelmat mukana lähdekoodin sisältävät työkaluja: -- Rakenna...

tigreBrowser on geenien ilmentyminen malli selain tuloksia tigre R paketti (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Asennus: tigreBrowser vaatii Python versio> = 2.5. tigreBrowser voidaan asentaa komennolla:python setup.py...

MACS2 on mallia, joka perustuu analyysiin työkalu ChIP-Seq tietoja.Parannuttua sekvensointitekniikoilla, kromatiinia immunosaostus seuraa korkea suoritusteho sekvensointi (ChIP-Seq) on tulossa suosittu opiskella genominlaajuisten...

edittag on sovellus kokoelma suunnitteluun sarjaa muokkaa metristä sekvenssimerkkejä, tarkkailun järjestyksessä tageja ulkomuotoa muokata metristä, ja integroimalla sekvenssimerkkejä laiturille erityisiä sekvensointi adapterit ja PCR-alukkeet. edittag...

MacMolPlt on nykyaikainen grafiikka ohjelma piirtämistä 3-D molekyylirakenteet ja normaalimoodit (tärinä)....

picme on Python paketti, joka sisältää ohjelmia arvioida ja juoni phylogenetic informatiivisuus suuria aineistoja. asennus Tällä hetkellä helpoin tapa asentaa ohjelma on:git klooni git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / path / to / picmeVoit...

SyntenyMiner on sovellus visualisoida ja kuulustella vertailuja joukossa useita täydellisiä genomisekvenssejä. Käyttöliittymä tarjoaa purjehduskelpoinen näkymä otteluita viite genomisekvenssin. Sekvenssin väliset ottelut kromosomit eri genomeja voidaan...

ProteinShop on interaktiivinen työkalu manipuloimalla proteiinirakenteita. Se on suunniteltu nopeasti luoda joukon proteiinin kokoonpanoissa käyttäen ihmisen tiedon ja intuition. Nämä kokoonpanot voi altistaa paikallisten tai maailmanlaajuisten...

PySCeS on projektin kehittämä Triple-J-ryhmän molekyylilääketieteen solufysiologian & nbsp; yrittääkseen malli ja ymmärtää monimutkaisia ​​prosesseja ja järjestelmiä, jotka muodostavat elävän solun. Ominaisuudet : tekstipohjainen mallin kuvaus...