Uusi Bioinformatiikka Varten Linux
toimiin paketti tarkka stokastisen simuloinnin reaktio-diffuusio järjestelmien mielivaltaisesti monimutkaisia 3D geometriaa. Meidän sydänsimulaation algoritmi on täytäntöönpano Gillespien SSA laajennettu käsittelemään diffuusion molekyylien yli...
NEO (Neural Ensemble Objects) ja on projekti antaa yhteiset perusluokat käytettäväksi hermo data-analyysi, jonka tavoitteena on saada OpenElectrophy, NeuroTools ja ehkä muita hankkeita, joilla on samankaltaisia tavoitteita enemmän lähekkäin.Kaksi...
OpenElectrophy on kehys helpottaa manipulointia, varastointi ja analysointi elektrofysiologiset tiedot. Se voi tuoda tietoja monista eri tiedostomuotoja ja tallentaa ne yhtenä SQL-tyyppinen tietokanta.Analyysi työkalut sisältyvät OpenELectrophy ovat...
turve on sarja ohjelmia syömällä, ennustamiseen ja analysointiin biofysikaaliset ominaisuudet proteiineja.Katso http://enzyme.ucd.ie/PEAT dokumentointia, ohjeet, kuvakaappauksia jne. Vaatimukset : ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) on tehokas ohjelma, joka tasaa suhteellisen lyhyt nukleotidisekvenssit vastaan pitkä referenssijakson kuten ihmisen genomin.Ohjelmisto toteuttaa kaksi algoritmeja, BWA-lyhyt ja BWA-SW. Entinen teokset tutkittaessa...
SSuMMo on kirjaston toimintoja suunniteltu noin iteratiivisesti HMMER määrittää sekvenssien taksonien. & Nbsp; tulokset ovat erittäin selityksineen Puissa laji / suvun jakautuminen yhteisön.Ohjelmat mukana lähdekoodin sisältävät työkaluja: -- Rakenna...
goby on Python API lukemiseen binaaritietoja tiedostoja käyttäen Merisää next-gen tietoja hoitosuunnitelmaa.Normaalisti tämän hakemiston tulee osana täydellisen Merisää paketti, saatavilla:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Täydellinen paketti sisältää...
PySCeS on projektin kehittämä Triple-J-ryhmän molekyylilääketieteen solufysiologian & nbsp; yrittääkseen malli ja ymmärtää monimutkaisia prosesseja ja järjestelmiä, jotka muodostavat elävän solun. Ominaisuudet : tekstipohjainen mallin kuvaus...
Pysam on Python-moduuli lukemiseen ja manipuloimalla Samfiles. & Nbsp; Se on kevyt kääre samtools C-API.Pikaopas on täällä. Tarkemmat asiakirjat on saatavilla täältä.Kysymykset ja kommentit ovat erittäin tervetulleita, ja olisi lähettää pysam...
TRMiner on Python apuohjelma, joka tähtää tieteellisen tiedon kuraattorit. & Nbsp; Sen avulla voidaan nopeasti karsia suuria kokoelmia tieteellisiä julkaisuja lauseita asiaan tietyn kaivos tavoite.Tämä saavutetaan kahdessa vaiheessa. Ensinnäkin tekstit...
