Ilmaiseksi Bioinformatiikka Varten Linux

toimiin paketti tarkka stokastisen simuloinnin reaktio-diffuusio järjestelmien mielivaltaisesti monimutkaisia ​​3D geometriaa. Meidän sydänsimulaation algoritmi on täytäntöönpano Gillespien SSA laajennettu käsittelemään diffuusion molekyylien yli...

tapiiri on Python työkalu, joka sisältää ohjelmia arvioida ja juoni phylogenetic informatiivisuus suuria aineistoja. siteeraavat tapir Kun käytät tapiiri, ota mainita:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir mahdollistaa suurikapasiteettisten analyysi...

picme on Python paketti, joka sisältää ohjelmia arvioida ja juoni phylogenetic informatiivisuus suuria aineistoja. asennus Tällä hetkellä helpoin tapa asentaa ohjelma on:git klooni git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / path / to / picmeVoit...

tigreBrowser on geenien ilmentyminen malli selain tuloksia tigre R paketti (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Asennus: tigreBrowser vaatii Python versio> = 2.5. tigreBrowser voidaan asentaa komennolla:python setup.py...

checkmyclones on ohjelmisto, joka tarjoaa työkaluja tarkistaa Sanger sekvensointitulokset & nbsp; (tai pelkkää tekstiä tai FASTQ tiedostot) vastaan ​​joukko viitesekvenssit, toimitetaan kaikki kohtuulliset muodossa (myös koordinaatit). vaatimukset ...

Syntainia on innovatiivinen sovellus visualisointiin useita genomien. & Nbsp; Se esittelee yksinkertaisen ja intuitiivinen käyttöliittymä katsella ja käsitellä suhteita geeniryhmien. Selkeämpi geeniä visualisointi, se on helpompi tutkijan tunnistaa...

CWC Simulator on C ++ täytäntöönpanoa CWC, hammaskivi edustus ja simulointi biologisten järjestelmien. & Nbsp; Onnistuneen asennuksen jälkeen (katso ASENNUS) voit ajaa simulaatioita yli CWC mallia, kuten on esitetty joitakin esimerkkejä (katso esimerkit...

Arem on perustuu MACS (malli Based Analysis ChIP-Seq data).High-throughput sekvensointi kytketty kromatiinin -immuunoelektroforeesin sateeseen (ChIP-sekvenssi), on laajalti käytetty karakterisoimiseksi genominlaajuisten sitoutumismalleja...

AHREA on OHJELMISTO sarja, joka auttaa löytämään Suhteellinen Expression Learners helppoa. Se on kirjoitettu Pythonilla. vaatimukset ...

E-Cell System on käsite rakentaa virtuaalisia soluja tietokoneissa.E-Cell System on olio-ohjelmistopaketti mallinnukseen, simulointiin ja analysointiin laajamittaisten monimutkaisten järjestelmien kuten biologiset solut, architected jota Kouichi Takahashi...